Las comunidades se organizaron en un intento por frenar la pandemia del Covid-19, tomando acciones como el cierre de entradas y salidas de las zonas, acudir con la gente más vulnerable y aislada de los pueblos para informar y aconsejar sobre los cuidados, además de buscar en lo natural un aporte por la falta de medicina tradicional.

Evelyn Johana Castillo, miembra de la Red de Mujeres de Ojojona, en el departamento de Francisco Morazán, fue detenida el 24 de marzo de 2020. Estuvo en una bartolina por más de 24 horas bajo amenaza constante. Una policía de esa zona encontró el momento propicio para cobrarle caro el haber defendido a una vendedora cuando la misma agente estaba intimidándola y trataba de que no siguiera con sus ventas en el parque días atrás. La agente escribió en el libro de novedades que la defensora violentó el toque de qued.

En el contexto de esta crisis sanitaria, el Poder Judicial es doblemente responsable de lo que pueda suceder a los defensores en relación con su vida y salud. Teniendo en cuenta que el Estado tiene la máxima responsabilidad sobre las personas que están bajo su custodia, en el caso de Guapinol, todavía es mayor porque están en prisión preventiva debido a la inutilidad de los recursos presentados ante las autoridades judiciales, señaló el Comité Municipal de Defensa de los Bienes Comunes y Públicos, en un comunicado difundido  este 19 de marzo de 2020.

Tras la captura este día 17 de marzo de 2020 de la defensora de derechos humanos, Aleyda Huete, en Choluteca, resurge la duda de la utilización de las influencias políticas del presidente del Congreso Nacional , Mauricio Oliva, para meter sus manos en las capturas y apertura de procesos penales contra personas defensoras de derechos humanos, periodistas y la disidencia política de esa zona de donde él es diputado.

El militar de las Fuerzas Armadas de Honduras ha regresado con más fuerza contra los indígenas tolupanes después de que la justicia de la zona le diera una sentencia irrisoria por amenazas y daños en noviembre de 2019.